بنیاد ملی علم ایران در راستای ارتقای سطح علمی دانشگاه‌های کشور و حمایت هدفمند از تولیدات علمی باکیفیت، از برخی دانشگاه‌های منتخب کشور حمایت می‌کند که دانشگاه علوم پزشکی اصفهان نیز یکی از دانشگاه‌های مشمول این حمایت است. در همین راستا، کارگروه توسعه برون‌دادهای علمی دانشگاه در قالب برنامه جهش (جریان‌سازی، هدایت و شتاب‌دهی) به‌صورت ویژه از انتشار مقالات علمی حمایت می‌کند. این حمایت مالی مستقل و جدا از تشویقی مقالات دانشگاه بوده و جایگزین آن نخواهد بود.
برنامه راهبردی جهش دانشگاه علوم پزشکی اصفهان در راستای توسعه توانمندی‌های پژوهشی و ارتقای مهارت‌های مدیریتی پژوهشگران، کارگاه تخصصی «مدیریت حرفه‌ای پروژه‌های تحقیقاتی» را برگزار می‌کند.